（本文所有内容仅为作者个人的分析与猜测，如有不同意见，欢迎一同探讨）
大家好，这里是柯研所rchh45。
《名侦探柯南》中的主线剧情因其精彩的智斗与对决，巧妙的线索安排和伏笔设置，一直以来具有巨大的吸引力，目前也是很多粉丝追漫追番的动力。从今天起，我将带大家以漫画为基准，从头梳理一遍柯南的主线剧情，希望能给大家展现出其魅力所在~
首先，我们从最“古老”的篇章——黑色探索篇讲起，本篇包含从File.1工藤新一变小至File.242杯户饭店事件落幕其间242话的内容。
注：File.234-237《黑暗中的死角》虽在本篇的范围之内，但其真正发挥作用是在下一篇章中，故未在表中列出。
工藤新一是日本有名的高中生【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目侦探，有一次在与青梅竹马的同学毛利兰一起到游乐园玩的时候，目击了黑衣男子的可疑交易现场。当时新一只顾着看交易，却忽略了背后来的另一个同伙。新一被他们灌下奇怪的药，醒来的时候发现，身体居然缩小了！变成小孩子的新一逃回了自己家门口，遇到了阿笠博士。博士了解情况后将新一带到家里，并对新一说，为了他和身边的人的安全，他的真实身份绝对不能被发现。此时小兰到新一家找他，当被问起名字时，新一报出了“江户川柯南”这个名字。随后，柯南住进了小兰家，利用小兰父亲毛利小五郎的侦探身份，搜查黑衣组织的情报……柯南与这个谜团重重的组织的斗争开始了！
然而，第一次与组织的接触，却是以一个生命在眼前的逝去为代价……
这一天，一【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目个叫广田雅美的女子前来毛利侦探事务所。广田雅美表面上在找她爸爸，实际上是10亿元抢劫案的主谋，同伙携款潜逃后一直在找寻同伙的下落。最后她成功拿回10亿元，将这些钱放在酒店柜子里后，就去与组织的两个成员——琴酒和伏特加会面。广田雅美本名宫野明美，组织跟她约定，如果抢劫10亿元的任务成功，就让她和她妹妹离开组织，否则就杀了她们，现在她成功完成任务，叫琴酒带她妹妹过来。
可组织本来就没有放走她妹妹的打算。由于明美男朋友的关系，组织不打算放过她，本想以任务失败为由除掉她，可她意外地完成了任务。组织对除掉明美的态度十分坚决，无论怎样都是死路一条。琴酒直接开枪杀了明美，将枪扔在附近后离开了。
柯南随后赶到，遇【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目见了奄奄一息的明美。明美告诉柯南，她只是这个组织最基层的人员，唯一知道的是组织的代表色是黑色，都穿着黑色的衣服，就像一群乌鸦一样。明美将寄放10亿元的柜台钥匙交给柯南，希望柯南能比组织早一步拿走。“拜托你了，小侦探……”明美说完后，就永远闭上了眼睛……
（File.16 恶魔般的女子）
由于枪上发现了明美的指纹，这起案件就以明美畏罪自杀结案，酒店里的10亿元最终也被找到。可柯南知道，这起案件真正的幕后主使者，仍在逍遥法外……
值得注意的是，宫野明美死亡案遭到动画组魔改，琴酒和伏特加被改成了与组织无关的人物，明美最后也没有死。为了弥补这个bug，动画组只好又让明美抢了一次银行，明美的抢钱金额翻了整整一【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目番。
第二次与组织接触，是在新干线上。柯南在新干线上遇到了当初那两个黑衣男子，并得到了他们的代号琴酒和伏特加。这段剧情又双叒叕遭到动画组魔改，琴酒和伏特加被改成两个无关人物，颜值也差了十万八千里。
第三次与组织接触，是在游戏发布会上。柯南偶遇正在与伏特加通话的组织成员龙舌兰，得知他在和某个人交易。不幸的是，由于他从交易对象那里获得号码牌被人调换过，他拿到的是装满炸弹的公文包，在厕所中查看时被炸死了。柯南从他的交易对象那里了解到，组织想要收购的是全世界能力杰出的电脑程式设计师名单，他们每次都在大黑大楼顶层的酒吧见面。柯南刚赶到那家酒吧，酒吧就被炸毁了，线索又一次中断。
这段时期，柯南都是单打独斗地搜集【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目组织的情报，得到的情报也比较少。而改变这个现状的，是一个转学生的到来……
这一天，柯南所在的班级转来了一位新同学——灰原哀。
（File.176 转校生是…）
转来当天少侦就卷入了一起案件中，案件解决后，柯南负责送灰原回家。回家的路上，灰原默念：“APTX4869……这就是你被灌下的药物的名称。”柯南一开始不信，灰原就继续说道，这是组织命令她研制的毒药，而她现在也吃了这个药。她是组织的成员，代号雪莉！
（File.178 代号雪莉）
灰原原来是组织里的药物研发人员宫野志保，宫野明美的妹妹。组织杀死了明美，却并不告诉灰原原因，灰原就用停止药物研究来反抗。组织将灰原关到房间里等待上级判决，绝望之际灰原吞下A【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目药企图自杀，幸运的是这种药物产生了与柯南同样的效果，灰原变成了小孩子，从房间中逃了出来。
由于服用药物的人员中只有新一没有确定死亡，灰原曾两次和组织的人到新一家调查。在第二次调查的时候，灰原发现新一小时候的衣服全部不见了。结合之前某只小白鼠服药后退化的实验结果，灰原有了一个可怕的想法：新一也像这只小白鼠一样，变成了小孩子。出于对这个实验对象的浓厚兴趣，灰原隐瞒了这个发现，并将A药名单上新一的信息由“不明”改成了“死亡”。现在灰原逃离组织，唯一可依赖的就是和她有相同遭遇的新一了。灰原在去往新一家的途中倒在了新一家门口，被博士发现收留。
了解缘由后，柯南考虑到，组织现在正在疯狂地寻找她，如果她随便乱跑【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目，很有可能会被组织发现，到时候自己也迟早会被揭穿，于是允许了灰原在博士家的寄住。
灰原想到曾将带有药物信息的磁片寄给了姐姐，而这张磁片现在在南洋大学的广田教授手上，柯南、灰原和博士一起去广田教授家拿取磁片以获取药物信息，不料教授被杀，他们在案件结束的一周后才拿到磁片。然而，在他们试图用电脑打开磁片时发现，这张磁片被装入了暗夜男爵病毒，若不用组织的电脑打开，里面的资料就会被全部销毁！辛辛苦苦拿到的药物资料一瞬间全部消失。
不过，虽然药物资料消失了，但柯南身边还是多了一个知悉组织信息的人，多了一个与他一同对抗组织的“战友”，柯南在与组织的对抗的道路上又迈出了一大步。
（File.181 为什么？）
之后在【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目一场球赛上，灰原在内心独白中表示，新一已经深深介入到组织从半个世界前就开始进行的秘密计划中了。
（File.189 被狙击的球）
在查看录像带寻找犯人时，灰原对柯南说：“人是不能违逆时光的洪流的，如果想勉强改变，就会得到惩罚。”这似乎直指组织的秘密计划。
（File.191 远方之眼）
经过一段时间后，灰原逐渐融入新的生活中，但她深知，自己是组织的叛徒，一旦被组织发现，她周边的人都会因她受到牵连，最近她开始做噩梦，梦见被琴酒发现，她和柯南都死在琴酒手里。然而，这场噩梦后来居然成真了……
（File.238 背叛的街角）
一个下雪天，灰原和柯南在回家的路上碰见了一辆保时捷356A，琴酒的爱车正是这种类型。柯【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目南叫来了博士，用衣架撬开了车子，并在车子里安装了窃听器和发信器。此时琴酒和伏特加从马路对面走过来，柯南和灰原赶紧下车躲在车子后面，琴酒并未发现他们，直接开车走了。
此时的柯南很是兴奋，终于可以获取琴酒的信息了！柯南在窃听器中了解到，琴酒在与一个叫皮斯克的人打电话，称目标会于18点整出现在杯户城市饭店，叫皮斯克在他被逮捕之前杀掉他，并且可以使用之前的那种药。
（File.238 背叛的街角）
然而，琴酒打完电话后在车上发现并认出了灰原的头发，同时也发现了窃听器。琴酒对于雪莉的“主动上门”很是高兴，既然刚才电话的内容透露给了她，那就趁此钓她出来。琴酒联系皮斯克，由于刚才的谈话里有提到药物的事情，雪莉一定【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目会到杯户饭店那里去，叫他帮忙抓住雪莉。
另一边，柯南决定前往杯户饭店阻止暗杀计划，而灰原也确实如琴酒所想，跟着来到了饭店。这是一位导演的追思会，社会名流都聚集在此。柯南锁定了皮斯克的暗杀对象——吞口议员，并联系警方对他进行监视。可随着幻灯片开始放映，会场的灯被关闭，吞口议员消失在视线中，最后被掉落的水晶灯砸死了。
柯南确认这就是皮斯克动的手。案发时柯南捡到了一条紫色手帕，并推测这个手帕与命案一定有关系，去柜台询问拥有紫色手帕的人，最后将皮斯克锁定在了七个人之中。
然而，就在柯南与灰原前往柜台时，皮斯克发现了灰原，对比雪莉的照片后确认了她就是琴酒嘱咐他抓捕的对象。此时警方开始放行，一大群人从会场涌出来【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目，柯南和灰原走散，皮斯克趁乱用药迷晕了灰原。
（File.240 不告而别）
皮斯克将灰原带到了一个酒窖里。另一边，柯南发现灰原不见后，立刻打电话叫警方扣留拥有紫色手帕的七个人，皮斯克还没来得及处置灰原，就要去接受警方的审讯。柯南联系上了灰原，经过一阵推理后，灰原打开了酒窖中的电脑，从中获取了一些药物信息，并存入到MO中。柯南让灰原喝下白干恢复原来的身体，从壁炉逃出酒窖。
琴酒、伏特加与皮斯克失去联系，通过电脑中的发信器来到酒窖，此时灰原躲在了壁炉中。二人准备离开酒窖时，琴酒在壁炉旁边发现了一根灰原的头发，并听到了她的呼吸声。琴酒还是先离开了，他想让雪莉死得漂亮些。琴酒和伏特加在离开酒窖后赶往楼顶，【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目在楼顶撞见了刚从壁炉中出来的灰原。
（File.241 来自过去的子弹）
琴酒对灰原连续开了很多枪，并问灰原她是如何从组织的毒气室中逃离的，灰原并没有回答，琴酒无奈只好直接杀死她。就在此时，一根麻醉针射在了他的胳膊上，柯南在寻找监禁灰原的酒窖时候，得到博士的消息说灰原在楼顶遭到枪击，连忙赶到楼顶来。柯南用变声器叫灰原逃进烟囱，而琴酒朝着自己胳膊开了一枪使自己保持清醒。
灰原落回酒窖变回小孩，遇见了接受完审讯的皮斯克。皮斯克认识灰原父母，听他们提过药物的事，因而能认出灰原是变小的雪莉。就在皮斯克准备杀死灰原时，房间里传来了柯南的声音。柯南早已推出皮斯克的身份——汽车公司董事长枡山宪三，也知道了他的作案【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目手法：用带有手帕的手枪瞄准带有荧光涂料的水晶灯链条让水晶灯掉落。但柯南不明白，只有拥有紫手帕的人才能通过审讯，他的手帕在自己手里，是怎么通过审讯的。
（File.242 白色世界）
皮斯克在酒窖抽烟引发火灾，柯南和灰原趁乱逃出房间。正当皮斯克怀疑他们逃到烟囱里时，琴酒从里面出来，并将枪对准了皮斯克！原来皮斯克开枪射击的画面被记者拍到，将会刊登在早报的头条上，BOSS命令琴酒杀了皮斯克。
柯南和灰原坐上博士的车逃离酒店，博士告诉柯南琴酒杀了皮斯克后从烟囱里逃走了，他们的身份没有暴露。
柯南认为组织对灰原的了解程度非常令人在意，组织仅凭一根头发就能断定出是灰原，那灰原以前肯定是处于组织的严密监视和精确掌控【我爱线报网】52线报网-专注分享活动首码线报优惠券零投网赚项目之中的吧。既然组织这么了解灰原，那么只要跟灰原的想法反着来就安全了。柯南问灰原日后的打算，灰原说既然组织已经知道她在这里了，就不能继续待下去了，明天就会离开。柯南表示，那你继续待在这里就是安全的了！
（File.242 白色世界）
另一边，琴酒对雪莉的逃走及帮她逃走的男人仍耿耿于怀。如柯南所料，琴酒并不打算继续在镇上寻找雪莉了。“没想到你还挺了解那个女孩的嘛”，车子后座的女人调侃道。这个女人，就是美国女演员，克里斯温亚德……
克里斯温亚德登场后又会发生怎样奇妙的故事呢？欲知后事如何，且听下回分解。
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